The Chromosome 7 Annotation Project
Home   GBrowse   Clinical Data   Data Tables   Download   Resources   Links   For Families  

Conserved Syntenic Blocks

Blocks of conserved synteny between human chromosome 7 and the mouse genome. Syntenic blocks were defined as regions of orthologous DNA encompassed by at least 10 consecutive syntenic anchors aligned in the same continuous orientation. A break of synteny is a jump of greater than 1 Mb in the corresponding mouse chromosome sequence, a change in orthologous chromosome, or a change in orientation of alignment (inversion) with the neighbouring syntenic block. A total of 36 mouse synteny blocks (35 breaks in synteny) were identified.
Chr7 Start Coordinate  Chr7 End Coordinate  Length  Orientation  Mouse Chr  Mouse Start Coordinate  Mouse End Coordinate  Length 
2601237  2601236  132777741  134675959  1898218 
2601238  2733078  131840  134778640  134681192  97448 
2733079  5959499  3226420  134802969  137158488  2355519 
5959500  7003407  1043907  138007949  137284703  723246 
7003408  12666896  5663488  4961557  10366641  5405084 
12666897  22687170  10020273  12  38562457  29343939  9218518 
22687171  22939941  252770  24371468  24530267  158799 
22939942  23383958  444016  17821513  18143575  322062 
23383959  33029045  9645086  46530862  54560566  8029704 
33029046  36468691  3439645  16761250  19865347  3104097 
36468692  36636017  167325  16714387  16603219  111168 
36636018  43860101  7224083  13  18288275  11533702  6754573 
43860102  53314879  9454777  11  3197799  12084996  8887197 
53314880  54019071  704191  11  12915367  12222820  692547 
54019072  55785691  1766619  11  12984533  14285847  1301314 
56204509  57273981  1069473  123760291  124511348  751057 
64537706  65902874  1365168  123813487  124351993  538506 
65902875  71455213  5552338  128046743  124280123  3766620 
71455214  73542272  2087058  129395788  128168037  1227751 
73542273  74981009  1438736  129398591  130045997  647406 
74981009  81119663  6138654  15419585  9733554  5686031 
81137847  84069994  2932147  12  22239707  19349788  2889919 
84069995  90270805  6200810  7776558  1141338  6635220 
90270806  90539540  268734  845457  1022114  176657 
90539541  91446058  906517  794881  195763  599118 
91446059  96303447  4857388  522392  4797387  4274995 
96303448  98554334  2250886  138006726  139285757  1279031 
98554335  100891170  2336835  131798383  130143630  1654753 
100891171  103854898  2963727  15402465  17768168  2365703 
103854899  106405991  2551092  12  31827242  29593469  2233773 
106405992  110777289  4371297  12  42964399  38605813  4358586 
110777290  147090204  36312914  10390573  44493899  34103326 
147090205  149000925  1910720  45329049  46418592  1089543 
149000926  151087512  2086586  18239080  19842075  1602995 
151087513  155528034  4440521  20697112  24274339  3577227 
155528035  157953789  2471965  12  66493706  65229425  1264281